父亲（烧瓶中的矮人）为什么要成为完美的人？

毒液与毒药！

为什么烧瓶中的矮人已经是不朽的人物，并且拥有使用七个致命罪（色欲，嫉妒等）的能力来做自己想做的事情，为什么他想要成为一个完美的存在？

...有权做他想做的...

实际上，这是不正确的。您是在暗示他已经拥有了他想要的东西（控制国家，强大的炼金术力量等等）。但是现实是，父亲想要的远不止于此。

实际上，父亲的真正动机是摆脱宇宙定律。由于他的成长经历被封闭在烧瓶中，因此他变得越来越需要不断摆脱自己视为界限的事情。

这个动机在 钢之炼金术师Wiki:

当与霍亨海姆面对此事时，父亲揭示了七个洪都拉斯的诞生只是为了使他成为一个完美的存在。最终，在他的最后时刻，父亲的动机被证明是不受宇宙本身定律的束缚。

并且以该系列的各种报价为后盾，包括以下内容：

何ものにも缚られず自由に広い世界に

[我想生活]在这个广阔的世界中，没有任何东西可以阻止[我]！

- 父亲， 兄弟会 第63，6:20

在他的脑海中，不仅Amestris的人民（乃至整个世界）都将他拒之门外，世界的自然规律也束缚了他。就像他被限制在烧瓶中时形成自卑感一样，他也感到世界在限制他无法获得他想要的自由。

为了使他有这种自由，他必须放弃并超越宇宙定律。反过来，他必须吸收和控制创造他的东西：“上帝”。这这就是为什么他想成为“完美的存在”。